工程质保金的扣留方式主要有两种：
逐次扣留
发包人在支付工程进度款时，按比例逐次扣留质保金。
计算基数通常不包括预付款的支付和扣回金额。
一次性扣留
在工程竣工结算时，一次性扣留质量保证金。
通常在工程竣工验收合格后进行。
质保金一般为合同双方当事人共同约定，依据法律规定，通常扣取工程总造价的5%作为质保金。
如果承包人违反了合同中的规定，质保金可能会被扣除作为处罚。
质保金的具体扣留流程可能包括：
质量保修期管理部门根据合同条款，向质量保证金管理部门提出扣除通知。
质量保证金管理部门审核后，通知合同乙方，并在质量保证金返还时扣除相应金额。
请注意，质保金的扣留应遵循合同条款和相关法律规定，确保合法合规
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