土地增值税的计入科目主要取决于企业的业务类型和会计政策。以下是几种常见的处理方法：
房地产企业
对于专门从事房地产经营的企业，土地增值税应当直接计入“税金及附加”科目。例如，房地产开发企业应计入“经营税金及附加”科目，对外经济合作企业应计入“营业税金”科目，股份制企业应计入“营业税金及附加”科目。
非房地产企业
对于非专营房地产开发的企业从事的房地产开发业务，土地增值税一般应当作为其他业务支出处理。例如，工业企业、商业企业、农业企业、交通企业、民航企业等企业应当计入“其他业务支出”科目。如果企业不划分主营业务收入和其他业务收入，那么土地增值税也应当作为营业税金的一部分计入“营业税金及附加”。
转让土地使用权或房产
当企业转让其已经作为固定资产等入账的土地使用权、房屋等，其应当缴纳的土地增值税应当计入“固定资产清理”等科目。
预征和汇算清缴
对于房地产企业，因其开发周期长，一般对其应缴纳的土地增值税采取平时预征、竣工结算后汇算清缴的方法。在项目交付使用前转让房地产预缴土地增值税，计入借方“应交税费-应交土地增值税”。项目全部交付使用后进行清算，收到退回多缴的土地增值税，应贷记“应交税费-应交土地增值税”。待该房地产营业收入实现时，转入“税金及附加”科目中。
兼营房地产业务的企业
兼营房地产业务的企业，应由当期负担的土地增值税，通过“其他业务成本”科目核算。
综上所述，土地增值税的计入科目可以是“税金及附加”、“其他业务支出”、“固定资产清理”等，具体计入哪个科目取决于企业的业务类型和会计政策。建议企业根据自身情况选择合适的科目进行核算，并在财务报表中予以充分披露。
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