先说结论，大将军大。
三公制度是秦朝确定下来的，而汉承秦制，所以汉朝建立之后，也设有三公。
最初，三公就是单纯指丞相、太尉、御史大夫。
到了汉武帝时期，三公就发生了变化。
汉武帝将掌管军权的太尉改为大司马，并且冠以将军之号，比如卫青为大司马大将军，霍去病为大司马骠骑将军，位在丞相之上，这个时候，朝中官位最高的其实是大司马大将军卫青，其次霍去病，其次是丞相、御史大夫。
所以，汉武帝时期，大将军比三公官大。
到了汉成帝时期，汉成帝把御史大夫改名为司空，协助丞相处理政务，此时的三公，叫做丞相、大司马、司空。
汉哀帝时期，丞相又改成了司徒，三公就成了司徒、大司马、司空。
直到光武帝刘秀建立东汉，又把大司马改回了太尉，因此东汉初年的三公，其实叫做太尉、大司徒、大司空。
后来，刘秀晚年又下诏，去掉三公中的“大”字，三公又变成了太尉、司徒、司空。
这个时候，三公的权力是非常大的，比如刺史、二千石官吏的任免权，都在三公的手中。
刘秀死后，后来的东汉皇帝们大多是幼年即位，这就导致了太后临朝、外戚专权现象的出现，三司的权力也逐渐被压缩。
比如邓骘，以车骑将军“仪同三司”，这就多出来了一个“仪同”，分掉了三公的部分权力。
汉和帝初年，窦太后临朝听政，让邓彪为“太傅录尚书事”，位在三公之上。
汉殇帝时期，邓太后临朝听政，让张禹为“太傅录尚书事”，位在三公之上。
这个时期，太傅、太尉、司徒、司空合称四府，三公之权事实上变成了四府之权。
但是大将军这个称号，和三公可不一样。
最初，汉武帝拜卫青为大司马大将军时，就已经明确规定，大司马大将军位在百官之上，而后来，霍光又以大司马大将军的职位辅政，算是开创了先河，从此外戚辅政，必任大将军。
所以大将军的权力，事实上是在三公之上的。
比如，东汉的外戚窦宪、梁商、梁冀等都是以大将军之位辅政。
所以，整个汉朝，总体的趋势就是大将军权力最大，由外戚权臣担任；太傅录尚书事权力次之，由威望的老臣担任；三公再次之。
而三公之中，也有变化，比如汉献帝时，董卓的职位是相国，相国是在丞相之上的，比如当年萧何就是由丞相进位相国的。
结束这个局面的，其实是曹操，曹操脑子比较活，曹操掌权之后，把这些乱七八糟的各种官位都给裁撤了，只设丞相、御史大夫两个官职，曹操自任丞相，让自己的亲信担任御史大夫，因此曹操得以大权在握。
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